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基于EST-SSR标记的福建云霄县和尤溪县野生茶树遗传多样性分析

杨军, 孔祥瑞, 王让剑

杨军, 孔祥瑞, 王让剑. 基于EST-SSR标记的福建云霄县和尤溪县野生茶树遗传多样性分析[J]. 茶叶学报, 2022, 63(1): 11-19.
引用本文: 杨军, 孔祥瑞, 王让剑. 基于EST-SSR标记的福建云霄县和尤溪县野生茶树遗传多样性分析[J]. 茶叶学报, 2022, 63(1): 11-19.
YANG Jun, KONG Xiang-rui, WANG Rang-jian. EST-SSR Marker-based GeneticDiversity Analysis on Wild Tea Germplasms from Yunxiao and Youxi Counties in Fujian[J]. ACTA TEA SINICA, 2022, 63(1): 11-19.
Citation: YANG Jun, KONG Xiang-rui, WANG Rang-jian. EST-SSR Marker-based GeneticDiversity Analysis on Wild Tea Germplasms from Yunxiao and Youxi Counties in Fujian[J]. ACTA TEA SINICA, 2022, 63(1): 11-19.

基于EST-SSR标记的福建云霄县和尤溪县野生茶树遗传多样性分析

基金项目: 福建省现代农业(茶叶)产业技术体系(闽农综2019[144]号);福建省属公益类科研院所基本科研专项(2021R11010030-8);福建省重点农业县农作物种质资源的调查收集及其评价与应用(A2017-8);农业高质量发展创新工程专项(XTCXGC2021004)
详细信息
    作者简介:

    杨军(1981-),男,硕士,助理研究员,从事茶树种质资源与遗传育种研究。E-mail: 99258768@qq.com

    通讯作者:

    杨军(1981-),男,硕士,助理研究员,从事茶树种质资源与遗传育种研究。E-mail: 99258768@qq.com

  • 中图分类号: S571.1;S336

EST-SSR Marker-based GeneticDiversity Analysis on Wild Tea Germplasms from Yunxiao and Youxi Counties in Fujian

  • 摘要: 为了对福建云霄县、尤溪县野生茶树种质资源初步鉴定与筛选,以福建省茶树主要栽培品种为参照,利用EST-SSR毛细管电泳荧光标记技术进行遗传多样性与亲缘关系分析。结果表明:云霄县、尤溪县野生茶树种质资源与参照品种亲缘关系较远,云霄县野生茶树种质资源与广东省凤凰水仙等类型茶树品种资源亲缘关系最接近;尤溪县野生茶树种质资源与参照品种亲缘关系较远。福建云霄县、尤溪县野生茶树种质资源平均等位基因数、有效等位基因数、期望杂合度、Shannon多样性指数(I)分别为3.8966,3.3103、2.4550,2.2908、0.5264,0.4980、0.9463,0.8595,说明遗传多样性较为丰富。群体间Nei’s遗传距离、遗传分化指数(FST)与分子方差分析(AMOVA)结果一致表明群体间存在显著遗传分化,且群体间的遗传变异为21%。本研究对野生茶树种质资源进行鉴定分析,为福建野生茶树种质资源发掘、利用和保护以及育种工作提供一定参考。
    Abstract: To identify and select tea germplasms in Yunxiao andYouxi counties in the wild, genetic diversity and relationship of the collectedsamples were analyzed in reference to the major cultivated tea varieties in theprovince by the technique of capillary electrophoresis using EST-SSR markers.The wild-type specimens were genetically remotely related to the referencevarieties. The Yunxiao germplasm was somewhat close to Phoenix Narcissus andothers from Guangdong province, whereas the Youxi samples differed greatly fromthe reference. The mean allele number, effective allele number, expectedheterozygosity, and Shannon diversity index of the Yunxiao germplasm were3.896, 2.455, 0.5264, and 0.9463, respectively, while those for the Youxispecimen, 3.310, 2.290, 0.4980, and 0.8595, respectively, indicating arelatively rich diversity. The Nei’s genetic distance, genetic differentiation index, andmolecular variance analysis (AMOVA) on the populations exhibited a significant21% variation. The results provided a basis for further exploitation,utilization, protection, and breeding of tea resources in the wild in Fujian.
  • 期刊类型引用(4)

    1. 林霜霜,陆佩兰,余文权,张海峰,赵杰樑,陈双龙,翁培铭,车建美,葛慈斌. 福建省农作物种质资源调查收集与多样性分析. 植物遗传资源学报. 2024(03): 340-355 . 百度学术
    2. 王攀,于文涛,吕水源,朱艳宇,兰振良,李青颖,李国来,贵文静,叶乃兴. 福建永泰茶树种质资源遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建. 福建农业学报. 2024(01): 66-74 . 百度学术
    3. 穆小婷,廖侦成,凌彩金,郑溪,林建勇,何建平,江丽冰. 基于SSR标记的55份清远野生茶树种质资源遗传多样性和亲缘关系分析. 中国茶叶. 2023(02): 36-43 . 百度学术
    4. 黄红宝,何应会,黄欣,孙开道,秦波,黄耀恒. 铁冬青叶绿体全基因组及系统进化分析. 农业研究与应用. 2022(05): 7-14 . 百度学术

    其他类型引用(3)

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  • 发布日期:  2022-03-30

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